雞年伊始,中國科學院深圳先進技術(shù)研究院陳志英團隊與華大基因等合作的一項癌癥研究成果發(fā)表在美國《癌癥醫(yī)學》雜志(Li X et al., Whole-exome sequencing predicted cancer epitope trees of 23 early cervical cancers in Chinese women. Cancer Medicine 2016 in production)。這個合作項目開發(fā)電子計算機算法,利用癌癥基因組學,構(gòu)建 23 個中國婦女早期宮頸癌的“癌癥抗原樹”,目的是幫助找出佳癌癥免疫治療靶點,以提高療效。
同人種的路線圖。除了膚色不同,人類種族間對疾病與治療的敏感性都有差異。同樣,癌癥起源于一個細胞,是基因突變積累的結(jié)果,這些突變產(chǎn)生很多新靶點,成為癌細胞獨有且理想的治療靶點,不會傷及正常細胞。由于突變不斷發(fā)生,衍生出許多細胞群,不同細胞群有不同的靶點組合,對治療的反應也不同。目前的免疫治療技術(shù),大多只針對部分細胞群,對于實體瘤來說,臨床上可使腫瘤縮小、病情穩(wěn)定,但殘留癌細胞群繼續(xù)生長,不久又復發(fā)。
“癌癥抗原樹”是團隊開發(fā)的新電子計算機算法,根據(jù)癌癥基因組學的資料,找出一個癌癥內(nèi)所有細胞群及其靶點之間的進化關(guān)系,幫助確定“樹干”上所有癌細胞共有的靶點,大大提高療效。該算法對指導發(fā)展新一代癌癥免疫治療技術(shù)有重要指導意義。該項目是團隊構(gòu)建中的“微環(huán) DNA 基因載體癌癥免疫治療技術(shù)平臺”的一個組成部分,旨在開發(fā)出安全、高效、方便、可負擔的抗癌基因藥。
圖為癌癥免疫抗原樹:A. 人類走出非洲并衍化出不同種族的路線圖;B.“癌癥抗原樹”描繪腫瘤細胞群及其攜帶的腫瘤抗原的相互關(guān)系;C.“癌癥抗原樹”幫助找出“樹干”上的靶點,像砍樹干把樹砍死一樣,高效治療腫瘤;D. 三個代表性宮頸癌抗原樹。