NCI使用BioMark基因工程系統(tǒng)開展研究

　　集成流體通路將促使有希望的基因易感性標記物更快發(fā)布

　　美國國立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health，NIH)下屬的主要癌癥研究機構國家癌癥研究所（National Cancer Institute，NCI）日前表示，該機構正在使用Fluidigm公司的BioMark基因工程系統(tǒng)，以高成本效益對其全基因組單核苷酸多態(tài)性（SNP）聯(lián)合掃描的結果進行快速、深入的研究。

　　美國國家癌癥研究所的核心基因分型技術中心（Core Genotyping Facility）采用Fluidigm公司的BioMark 96.96動態(tài)陣列，進行中等數(shù)量的多重（medium-plex）單核苷酸多態(tài)性基因分型。國家癌癥研究所正在進行多項全基因組聯(lián)合掃描（GWAS）。上述計劃的主要目標是，加快聯(lián)合掃描中發(fā)現(xiàn)的有希望的基因易感性標記物的復制和發(fā)布工作。

　　Fluidigm公司總裁兼首席執(zhí)行官Gajus Worthington說，“Fluidigm的新型96.96動態(tài)陣列能夠幫助國家癌癥研究所大幅提高其癌癥基因分型研究的服務能力。他們使用本公司48.48陣列以來一直都很順利，在他們進行的比較測試中，F(xiàn)luidigm的新型96.96陣列的表現(xiàn)極為突出。”

　　Worthington又說，“國家癌癥研究所的核心基因分型技術中心與其他政府研究中心和學術機構的研究人員展開合作，共同開發(fā)用于辨別具體形式的癌癥的易感個體篩查技術。我們的96.96動態(tài)陣列的檢出率（call rate）達到99%以上，一天能夠處理70000多個基因型。”

　　美國國家癌癥研究所已完成一項前列腺癌全基因組聯(lián)合掃描的后續(xù)深入研究，使用了近60種SNP，用標準的5'-核酸酶聚合酶鏈式反應（PCR）化學技術和BioMark™動態(tài)陣列，對15000個試樣進行了測定。2008年6月1日，在西班牙巴塞羅那舉行的歐洲人類遺傳學學會2008年年會上，美國國家癌癥研究所基因組掃描操作與分析研究帶頭人Kevin Jacobs介紹了本次研究的結果。

　　Fluidigm公司發(fā)明了集成流體通路（integrated fluidic circuit，IFC）。該公司的的BioMark系統(tǒng)采用集成流體通路技術來簡化操作，提高通量，實現(xiàn)納升級的精密度，并能為高通量的基因分型應用節(jié)省大量成本（試劑用量更少，試樣更?。?。使用Fluidigm公司的新款96.96動態(tài)陣列，國家癌癥研究所能夠借助96組引物-探針組合來測定96個試樣，一次產(chǎn)生9216個反應。集成流體通路只需要192步移液操作（與之相比，如果在384個微井的標準板片上進行這樣規(guī)模的試驗，需要完成18000多步移液操作）。