日前,以“融合創(chuàng)新方案,芯領(lǐng)醫(yī)療” 為主題的第三屆英特爾生命科學(xué)信息技術(shù)論壇舉行。來自政府、醫(yī)學(xué)界、產(chǎn)業(yè)界、學(xué)術(shù)界等的代表齊聚一堂,分析數(shù)據(jù)驅(qū)動下的醫(yī)療現(xiàn)狀與挑戰(zhàn),分享全球趨勢和新興機(jī)會,共同探討本土創(chuàng)新與實(shí)踐。同時(shí),本屆論壇公布了一系列醫(yī)療領(lǐng)域的重要成果,進(jìn)一步加速了醫(yī)療的普及化進(jìn)程。
數(shù)據(jù)驅(qū)動醫(yī)療創(chuàng)新與變革“數(shù)據(jù)是醫(yī)療行業(yè)發(fā)展的‘原力’,準(zhǔn)確、海量的數(shù)據(jù)是醫(yī)療的重要實(shí)現(xiàn)條件,如何有效地匯集、存儲、管理和分析數(shù)據(jù)是目前醫(yī)療面臨的關(guān)鍵挑戰(zhàn)?!笨萍疾恐卮罂茖W(xué)計(jì)劃轉(zhuǎn)錄組研究首席科學(xué)家、中國科學(xué)院北京基因組研究所研究員于軍表示,以數(shù)據(jù)分析、云計(jì)算為主導(dǎo)的IT技術(shù)正與生物技術(shù)有機(jī)融合,從而實(shí)現(xiàn)對海量數(shù)據(jù)的提取和分析等,推動醫(yī)療的創(chuàng)新和落地。
英特爾創(chuàng)新成果推動醫(yī)療普及化
“醫(yī)療是數(shù)據(jù)驅(qū)動的科學(xué),是生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)技術(shù)和計(jì)算技術(shù)融合的前沿領(lǐng)域?!庇⑻貭柟救蚋笨偛眉嬷袊鴧^(qū)總裁楊旭表示,“對海量數(shù)據(jù)和各種形態(tài)數(shù)據(jù)的處理和分析是醫(yī)療的重點(diǎn)。英特爾作為一家數(shù)據(jù)公司,不斷拓展計(jì)算的邊界,提供大數(shù)據(jù)、云計(jì)算、人工智能以及網(wǎng)絡(luò)存儲等技術(shù),促進(jìn)醫(yī)療的快速發(fā)展?!?
創(chuàng)新成果推動 醫(yī)療普及化
目前,中國醫(yī)療已經(jīng)成為國家層面推動和市場力量主導(dǎo)的戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)。與會代表表示,中國正立于醫(yī)療的潮頭,具備得天獨(dú)厚的發(fā)展土壤。在數(shù)據(jù)的推動下,企業(yè)、醫(yī)生、醫(yī)院、基金組織和政府部門正在推進(jìn)緊密合作。從本屆論壇上發(fā)布的 一系列創(chuàng)新成果上可一窺端倪。 論壇上,博德研究所、英特爾、華大基因、阿里云和浪潮聯(lián)合宣布推出BIGstack解決方案和GATK中國社區(qū)。美國博德研究所GATK團(tuán)隊(duì)代表Kate Voss表示,博德研究所開放了GATK4的源代碼,并與英特爾攜手利用英特爾CPU、Omni-Path Fabric和SSD開發(fā)了博德—英特爾基因組學(xué)堆棧(BIGstack)的突破性架構(gòu)。此外,華大基因?qū)⒉捎眯碌腉ATK工具,并與阿里云合作,使客戶能夠在華大基因在線平臺上訪問GATK4、博德的工作流管理系統(tǒng)Cromwell以及WDL(工作流定義語言)。浪潮人工智能與高性能事業(yè)部總經(jīng)理劉軍表示,BIGstack這個(gè)交鑰匙解決方案將作為參考設(shè)計(jì),通過原始設(shè)備制造商(OEM)和系統(tǒng)集成商來提供,浪潮是中國提供這個(gè)交鑰匙解決方案的OEM合作伙伴。據(jù)悉,GATK中國社區(qū)將為生態(tài)系統(tǒng)合作伙伴提供技術(shù)支持,合作伙伴致力于基于GATK4、Cromwell和WDL的研究和應(yīng)用。
此外,英特爾與上海市兒童醫(yī)院宣布啟動兒童健康協(xié)作云中心。該云中心是一個(gè)開放式平臺,是雙方針對兒童遺傳基因組研究和數(shù)據(jù)交換應(yīng)用于臨床的范例。在合作伙伴的共同努力下,這一佳數(shù)據(jù)交換框架已在上海市兒童醫(yī)院、聯(lián)盟醫(yī)院和上海交大生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化中心上線。同時(shí),諾禾致源與英特爾共同成立基于RSD的可擴(kuò)展基因組學(xué)中心,通過提高大規(guī)模數(shù)據(jù)處理能力以滿足全球化、可擴(kuò)展基因組數(shù)據(jù)中心模式的需求。
華大基因副總裁王洪琦表示,華大基因推出采用英特爾FPGA的基因組一體機(jī)?;贔PGA的基因一體機(jī)加速了基因分析流程,提供更高的計(jì)算性能和更低的能耗,滿足中國基因組學(xué)研發(fā)對基因組數(shù)據(jù)處理的新要求。
值得一提的是基因組一體機(jī)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的成立。該實(shí)驗(yàn)室是英特爾醫(yī)療伙伴計(jì)劃的下屬聯(lián)盟,浪潮、UEC、華大基因、聚道科技、阿里云、Falcon和安諾優(yōu)達(dá)與英特爾合作打造的,為醫(yī)院和研究機(jī)構(gòu)客戶開發(fā)基因組學(xué)設(shè)備,以便處理本地?cái)?shù)據(jù)分析需求,并提供更好的用戶體驗(yàn)和出色的性能。
對此,英特爾醫(yī)療與生命科學(xué)集團(tuán)亞太區(qū)總經(jīng)理李亞東表示:“實(shí)現(xiàn)”2020年一天內(nèi)完成基因數(shù)據(jù)的收集、分析和解讀“的愿景,推動醫(yī)療走好每一步,中國要在普及化上越走越快?!?/p>