《每日科學(xué)》2011年9月1日?qǐng)?bào)道——由瑞士聯(lián)邦理工學(xué)院(ETH)Yaakov Benenson教授與麻省理工Ron Weiss教授率領(lǐng)的研究小組成功地將生物“計(jì)算機(jī)”診斷網(wǎng)絡(luò)導(dǎo)入人類細(xì)胞。該網(wǎng)絡(luò)有識(shí)別某些腫瘤細(xì)胞的能力,利用五種腫瘤特異性分子因子的邏輯組合,進(jìn)而觸發(fā)腫瘤細(xì)胞毀滅過程。
開發(fā)活體細(xì)胞內(nèi)運(yùn)作的生物電腦,是ETH蘇黎世分院合成生物學(xué)教授Yaakov (Kobi) Benenson孜孜以求的目標(biāo),其職業(yè)生涯的大部分時(shí)間都傾注于此。他想建立既能偵測(cè)細(xì)胞生存狀況、又能在細(xì)胞異常時(shí)對(duì)相應(yīng)信息進(jìn)行處理以提供合適的治療響應(yīng)的生物微機(jī)。目前,通過與麻省理工教授Ron Weiss以及團(tuán)隊(duì)成員(包括博士后學(xué)者Zhen Xie 與 Liliana Wroblewska、博士生Laura Prochazka)合作,他向這一目標(biāo)邁出了重大一步。
這一研究成果已發(fā)表于《Science》(見本文所附參考文獻(xiàn)),論文介紹了一種多基因合成“電路”;此電路負(fù)責(zé)鑒別正常細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞、繼而進(jìn)一步摧毀腫瘤細(xì)胞。其工作方式是:對(duì)細(xì)胞內(nèi)五種腫瘤特異性分子因子及其出現(xiàn)頻率進(jìn)行抽樣與綜合;只有當(dāng)所有這些因子在細(xì)胞內(nèi)同時(shí)出現(xiàn)時(shí),該電路才會(huì)作出正識(shí)別響應(yīng)。這種方式使得偵測(cè)腫瘤的準(zhǔn)確率非常高。研究者希望這一成果能夠?yàn)楦咛禺愋钥拱┲委煹於ɑA(chǔ)。
對(duì)腫瘤細(xì)胞的選擇性破壞
本研究對(duì)實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的兩種類型人類細(xì)胞進(jìn)行了基因網(wǎng)絡(luò)測(cè)試:海拉細(xì)胞(子宮頸癌細(xì)胞)與正常細(xì)胞。當(dāng)基因生物微機(jī)被導(dǎo)入這兩種不同的細(xì)胞類型時(shí),只有海拉細(xì)胞被摧毀,而正常細(xì)胞則安然無恙。
當(dāng)然,取得這一結(jié)果需要做大量的基礎(chǔ)工作。首先必須找出海拉細(xì)胞特有的分子組合。Benenson及其他小組成員在屬于小RNA分子(MicroRNA或miRNA)這一類化合物的分子中找,終于確認(rèn)其中一個(gè)miRNA組合(或者說“可識(shí)別屬性”)只有海拉細(xì)胞才有,其它健康細(xì)胞類型內(nèi)則不存在。
發(fā)現(xiàn)這種可識(shí)別屬性是一項(xiàng)頗具挑戰(zhàn)性的任務(wù)。人體內(nèi)既存在250種不同的健康細(xì)胞類型,此外也存在為數(shù)眾多的腫瘤細(xì)胞的變異型(其中數(shù)百種可作實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng))。但miRNA多樣性則更是不讓須眉花樣繁多,人類細(xì)胞中已得以描述的即達(dá)500到1000不同種類。Benenson指出:“每種健康或病損細(xì)胞類型都有其不同的miRNA分子處于開放或關(guān)閉狀態(tài)。”
可識(shí)別腫瘤屬性中的五種因子
確立一種miRNA“可識(shí)別屬性”與發(fā)現(xiàn)一組癥狀以可靠診斷一種疾病有所不同。教授說:“一種癥狀,比如說發(fā)熱吧,不可能由此概括出一種疾病。醫(yī)生獲得的信息越多,其診斷才越可靠。” 一年半前他從哈佛大學(xué)到ETH后,研究小組找到了幾種因子,可由此可靠地將海拉細(xì)胞從所有其它健康細(xì)胞中鑒別出;結(jié)果表明,僅僅五種特定miRNA的組合(其中某些以高水平出現(xiàn),某些則以極低水平出現(xiàn))就足以將海拉細(xì)胞從其混跡的健康細(xì)胞中揪出來。
與微機(jī)運(yùn)作相似的網(wǎng)絡(luò)
Benenson介紹說:“這些miRNA因子在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行邏輯代數(shù)運(yùn)算;該生物微機(jī)運(yùn)用諸如‘與’與‘非’等邏輯操作將這些因子進(jìn)行組合,并且,當(dāng)全部因子的整體運(yùn)算結(jié)果為邏輯‘真’值時(shí),只產(chǎn)生所需要的結(jié)果——那就是細(xì)胞死亡。” 確實(shí),研究者已經(jīng)能夠顯示該網(wǎng)絡(luò)在活體細(xì)胞內(nèi)可以非常穩(wěn)定地運(yùn)作,可正確組合所有細(xì)胞內(nèi)因子并給出正確的診斷。Benenson認(rèn)為,這一成果代表該領(lǐng)域的一項(xiàng)重大成就。
動(dòng)物模型與基因療法
該研究小組想在下一步在合適的動(dòng)物模型上測(cè)試該細(xì)胞計(jì)算方法,以期在未來創(chuàng)建診斷與治療工具。這聽起來可能象科幻小說,但Benenson相信其可行性;不過,仍有不少棘手的問題需要解決。比如,如何有效、安全地將外源基因?qū)爰?xì)胞?這種DNA遞送在目前情況下頗具挑戰(zhàn)性。尤其是,該方法需要將外源基因暫時(shí)而不是導(dǎo)入細(xì)胞。現(xiàn)有的病毒導(dǎo)入法或化學(xué)導(dǎo)入法均未充分開發(fā),需要進(jìn)一步完善。
Benenson說:“為人類提供一種功能完善的治療方法還非常遙遠(yuǎn)。不過這一工作是重要的步,顯示了單一細(xì)胞水平上這樣一種選擇性診斷方法具有可行性。”