近期,美國北卡羅來納州立大學的科學家開發(fā)出一個可將DNA序列轉(zhuǎn)譯成圖像的新工具,這將有助于鑒別導致癌癥、亨廷頓氏癥以及其他遺傳疾病的DNA圖譜的實時變化,從而使研究人員能更迅速、更有效地區(qū)分遺傳模式。
據(jù)了解,該項研究由北卡羅來納州立大學計算機科學系博士生戴維.考克斯設(shè)計??伎怂箤υ搨€工具的工作原理進行了詳細的介紹:DNA由4種核苷酸組成,分別用字母A、T、G和C表示,這些核苷酸的每三個字母串,如AAA或ATG等稱為3基體(3-mers)??伎怂菇忉屨f,有64種3基體,每個3基體用數(shù)字0至63來表示。符號散點圖工具將用一個很長的字符串來表示DNA序列,并將其以一個個的3基體形式分開。為每個3基體畫一個點,將數(shù)字0至63作為Y軸。X軸則代表3基體出現(xiàn)在基因序列中的順序。由此產(chǎn)生的散點圖就可揭示原始DNA中的有趣圖樣。將這些散點串在一起就能制成動畫用來比較DNA序列??伎怂惯x擇3基體的原因是其與密碼子相關(guān),密碼子是人體在生產(chǎn)蛋白質(zhì)過程中插入一個特定氨基酸所用的遺傳代碼。
確定DNA序列中的圖樣是很重要的,因為它能幫助研究人員在癌癥等疾病患者和健康人之間鑒別實時的基因變異。改進相關(guān)DNA序列的鑒別力,將有望加快開發(fā)出各種疾病的更成功的治療方法,并允許研究人員將重點放在和疾病相關(guān)的部分DNA上,使人們增強對這些疾病遺傳機制的了解。
【編 輯:侯 婷】