新產(chǎn)品將Illumina Genome Analyzer的讀長(zhǎng)和安捷倫SureSelect平臺(tái)有效結(jié)合,大大簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)操作流程
4月30日,北京——Illumina公司(NASDAQ:ILMN)和安捷倫科技(NYSE:A)于日前宣布,他們已經(jīng)啟動(dòng)了一個(gè)非排他性的合作市場(chǎng)營(yíng)銷協(xié)議,旨在支持一項(xiàng)可以幫助研究人員進(jìn)行靶向測(cè)序研究,全新的并且可擴(kuò)展的解決方案。Illumina的Genome Analyzer是一款已經(jīng)獲得了廣泛認(rèn)同的新一代測(cè)序平臺(tái)。安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng),針對(duì)該平臺(tái)進(jìn)行了特別優(yōu)化,為研究人員提供了一種可以對(duì)基因組中感興趣的特定區(qū)域進(jìn)行有效測(cè)序的方法。這種低成本高效益的方法,不僅大大簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)室的處理過程,而且同時(shí)提供了測(cè)序數(shù)據(jù)的均一覆蓋度和高可比對(duì)率。安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)與Illumina的Genome Analyzer的組合應(yīng)用,可以讓研究人員突破技術(shù)瓶頸,從事以往無法進(jìn)行的研究。
在美國(guó)癌癥研究協(xié)會(huì)(AACR)本周于科羅拉多州丹佛市召開的會(huì)議上,Illumina和安捷倫突出展示了他們聯(lián)合推出的解決方案的優(yōu)點(diǎn)。這一新的研究方案,幫助研究人員在得益于起始樣品量要求很低優(yōu)點(diǎn)的同時(shí),還能夠檢測(cè)多個(gè)感興趣的區(qū)域,從而檢出罕見的基因突變(如在癌癥中常見的突變)。靶向測(cè)序技術(shù),也使研究人員除了可以對(duì)候選基因和候選區(qū)段進(jìn)行測(cè)序外,還可以對(duì)全基因組關(guān)聯(lián)研究中確定的區(qū)域進(jìn)行測(cè)序。
麻省理工學(xué)院Broad研究院的基因組測(cè)序和分析項(xiàng)目主任Chad Nusbaum,在2009年2月的Nature Biotechnology雜志上介紹了安捷倫SureSelect采用的雜交選擇技術(shù)(論文聯(lián)接):“我們開發(fā)了一種雜交選擇方法,用于捕獲基因組的特定序列。該方法具有靈活性、可擴(kuò)展性和高效率的特點(diǎn)?;陔s交選擇的靶向捕獲,在很多應(yīng)用領(lǐng)域可能極為有用。例如,對(duì)受到無關(guān)DNA嚴(yán)重污染、珍貴、保存久遠(yuǎn)的DNA的捕獲,對(duì)臨床樣本中病毒群體的深度測(cè)序,或?qū)Νh(huán)境或醫(yī)學(xué)樣本的宏基因組學(xué)分析等。”在上述這些應(yīng)用中,如果選擇傳統(tǒng)的單重PCR方法,可能費(fèi)用過高或者通量過低。
“我們與安捷倫的合作強(qiáng)調(diào)了我們將新一代測(cè)序技術(shù)推向應(yīng)用的承諾,幫助研究人員用以往不可想象的規(guī)?;瘉碛?jì)劃并實(shí)施研究工作。”Illumina公司總裁兼首席執(zhí)行官Jay Flatley說:“我們將不斷擴(kuò)展我們的解決方案系列產(chǎn)品,提供更多可用于基因組變異研究的強(qiáng)有力工具。這個(gè)解決方案為研究人員提供了一種低成本、高效益、易于自動(dòng)化而且靈活的靶向測(cè)序方法,完全可以適用于多種不同的應(yīng)用領(lǐng)域。”
“安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng),只需要新一代測(cè)序操作流程中已有的標(biāo)準(zhǔn)設(shè)備,就可以運(yùn)行。”安捷倫科技副總裁兼生命科學(xué)事業(yè)部總經(jīng)理Nick Roelofs博士說,“安捷倫是市場(chǎng)上一家能夠準(zhǔn)確、可靠地定制生產(chǎn)含有100個(gè)以上堿基對(duì)的寡核苷酸的制造商。SureSelect平臺(tái)憑借安捷倫的這一獨(dú)有能力,能夠高度特異地捕獲基因組變異。通過SureSelect與Illumina Genome Analyzer的聯(lián)合應(yīng)用,研究人員可以自行設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),利用Illumina的讀長(zhǎng)能力,獲得及時(shí)、可重現(xiàn)的結(jié)果,并同時(shí)降低成本和提高耐用性。 SureSelect系統(tǒng),使研究人員能夠方便有效地通過eArray探針設(shè)計(jì)工具完成自定義設(shè)計(jì),并且可以結(jié)合自動(dòng)化系統(tǒng)以獲得更高的可擴(kuò)展性和成本效益。”
【編 輯:侯 婷】