新產(chǎn)品將Illumina Genome Analyzer的讀長和安捷倫SureSelect平臺有效結(jié)合,大大簡化實驗操作流程
4月30日,北京——Illumina公司(NASDAQ:ILMN)和安捷倫科技(NYSE:A)于日前宣布,他們已經(jīng)啟動了一個非排他性的合作市場營銷協(xié)議,旨在支持一項可以幫助研究人員進行靶向測序研究,全新的并且可擴展的解決方案。Illumina的Genome Analyzer是一款已經(jīng)獲得了廣泛認同的新一代測序平臺。安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng),針對該平臺進行了特別優(yōu)化,為研究人員提供了一種可以對基因組中感興趣的特定區(qū)域進行有效測序的方法。這種低成本高效益的方法,不僅大大簡化了實驗室的處理過程,而且同時提供了測序數(shù)據(jù)的均一覆蓋度和高可比對率。安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)與Illumina的Genome Analyzer的組合應用,可以讓研究人員突破技術(shù)瓶頸,從事以往無法進行的研究。
在美國癌癥研究協(xié)會(AACR)本周于科羅拉多州丹佛市召開的會議上,Illumina和安捷倫突出展示了他們聯(lián)合推出的解決方案的優(yōu)點。這一新的研究方案,幫助研究人員在得益于起始樣品量要求很低優(yōu)點的同時,還能夠檢測多個感興趣的區(qū)域,從而檢出罕見的基因突變(如在癌癥中常見的突變)。靶向測序技術(shù),也使研究人員除了可以對候選基因和候選區(qū)段進行測序外,還可以對全基因組關(guān)聯(lián)研究中確定的區(qū)域進行測序。
麻省理工學院Broad研究院的基因組測序和分析項目主任Chad Nusbaum,在2009年2月的Nature Biotechnology雜志上介紹了安捷倫SureSelect采用的雜交選擇技術(shù)(論文聯(lián)接):“我們開發(fā)了一種雜交選擇方法,用于捕獲基因組的特定序列。該方法具有靈活性、可擴展性和高效率的特點。基于雜交選擇的靶向捕獲,在很多應用領(lǐng)域可能極為有用。例如,對受到無關(guān)DNA嚴重污染、珍貴、保存久遠的DNA的捕獲,對臨床樣本中病毒群體的深度測序,或?qū)Νh(huán)境或醫(yī)學樣本的宏基因組學分析等。”在上述這些應用中,如果選擇傳統(tǒng)的單重PCR方法,可能費用過高或者通量過低。
“我們與安捷倫的合作強調(diào)了我們將新一代測序技術(shù)推向應用的承諾,幫助研究人員用以往不可想象的規(guī)模化來計劃并實施研究工作。”Illumina公司總裁兼首席執(zhí)行官Jay Flatley說:“我們將不斷擴展我們的解決方案系列產(chǎn)品,提供更多可用于基因組變異研究的強有力工具。這個解決方案為研究人員提供了一種低成本、高效益、易于自動化而且靈活的靶向測序方法,完全可以適用于多種不同的應用領(lǐng)域。”
“安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng),只需要新一代測序操作流程中已有的標準設(shè)備,就可以運行。”安捷倫科技副總裁兼生命科學事業(yè)部總經(jīng)理Nick Roelofs博士說,“安捷倫是市場上一家能夠準確、可靠地定制生產(chǎn)含有100個以上堿基對的寡核苷酸的制造商。SureSelect平臺憑借安捷倫的這一獨有能力,能夠高度特異地捕獲基因組變異。通過SureSelect與Illumina Genome Analyzer的聯(lián)合應用,研究人員可以自行設(shè)計實驗,利用Illumina的讀長能力,獲得及時、可重現(xiàn)的結(jié)果,并同時降低成本和提高耐用性。 SureSelect系統(tǒng),使研究人員能夠方便有效地通過eArray探針設(shè)計工具完成自定義設(shè)計,并且可以結(jié)合自動化系統(tǒng)以獲得更高的可擴展性和成本效益。”
【編 輯:侯 婷】