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scRNA-seq技術的進展及其在癌癥研究中的應用

文章來源:健康界發(fā)布日期:2023-08-29瀏覽次數:61

1scRNA-seq技術的進展及其在癌癥研究中的應用

內容概要:介紹了scRNA-seq技術的基本過程和發(fā)展,并探討了其在癌癥研究和臨床實踐中的應用。癌癥是一組異質性疾病,scRNA-seq技術可以幫助我們理解腫瘤異質性和腫瘤微環(huán)境,從而更好地了解腫瘤發(fā)生、進展、轉移和藥物耐受性的機制。

2內源性腺嘌呤介導糖尿病模型的腎損傷并預測患者的糖尿病腎病

內容概要:研究了糖尿病患者中內源性腺嘌呤的作用,發(fā)現尿腺嘌呤/肌酐比值(urine adenine/creatinine ratio,UAdCR)可能是末期腎?。?/span>end-stage kidney disease,ESKD)的機制生物標志物。此外,腺嘌呤通過哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycinmmTOR)刺激腎小管細胞中的基質生成,并在小鼠腎臟中刺激mTOR。

3肺泡巨噬細胞的訓練免疫通過KLF4-MERTK介導的吞噬作用增強損傷修復

內容概要:通過轉錄組分析和功能實驗發(fā)現,經過細菌內毒素或銅綠假單胞菌預處理的肺泡巨噬細胞(alveolar macrophages,AMs)表現出更強的抵抗病原體誘導的細胞死亡的能力。AMs的重編程通過轉錄因子KLF4介導了吞噬作用受體MERTK的表達上調。將這些訓練后的AMs移植到暴露于致命銅綠假單胞菌的受體小鼠中,可以限制炎癥性肺損傷。

4臨床介導的CD8+ T細胞和NK細胞中的焦亡作用通過單細胞和bulk測序揭示黑色素瘤的異質性

內容概要:通過單細胞轉錄組和bulk RNA-seq的綜合分析,發(fā)現黑色素瘤組織中免疫細胞(如CD8+ T細胞和NK細胞)的存在減少可能會降低焦亡的能力,從而對抗黑色素瘤的能力也會降低。此外,研究還構建了一個預后風險模型和個性化診斷圖表,表明焦亡相關基因在惡性黑色素瘤預防中可能發(fā)揮重要作用。

5單細胞轉錄組學揭示重癥肌無力危象中的高細胞介質癥的外周免疫景觀

內容概要:利用單細胞轉錄組學和免疫庫測序技術,發(fā)現在危機期和危機后,存在一種名為單核細胞3FCGR3B單核細胞)的獨特亞群,其表達了的促炎癥信號通路。此外,年齡相關的B細胞和CD4、CD8 T細胞存在自身免疫活性和持續(xù)的T細胞疲勞。這些結果表明,肌無力危象中的先天免疫激活與高細胞介質癥有關。

6單細胞轉錄組學揭示急性髓性白血病患者化療后外周血單核細胞的免疫細胞異質性

內容概要:使用scRNA-seq技術,發(fā)現急性髓系白血?。?/span>acute myeloid leukaemia,AML)患者的T細胞、NK細胞、單核細胞、樹突狀細胞(dendritic cellsDCs)和造血干細胞祖細胞(haematopoietic stem cell progenitors,HSC-Prog)的亞群簇多樣性存在差異。NK細胞和單核細胞-DCs在轉錄因子表達和染色體拷貝數變異(chromosome copy number variation,CNV)方面表現出變化。HSC-Prog細胞中的CNV和細胞間相互作用網絡也存在的異質性。