肺癌是全球疾病死亡的主要原因之一,幾乎占所有癌癥相關(guān)死亡人數(shù)的 25%,篩查手段是降低肺癌死亡率的有效有效方法。肺結(jié)節(jié)是早期肺癌的常見征象,良、惡性肺結(jié)節(jié)在 CT 中常常顯示出相似的特征(例如:大小和密度),所以其良惡性判斷仍是臨床亟需解決的問題,明確診斷只能通過侵入性組織病理活檢的方式達(dá)成。當(dāng)前,通過新型液體活檢的生物標(biāo)志分子圖譜分析在肺結(jié)節(jié)良惡性的檢出方面具有廣泛前景,其中參與腫瘤細(xì)胞生物信息傳遞的循環(huán)細(xì)胞外囊泡(sEVs)由于攜帶著相關(guān)遺傳物質(zhì),對(duì)于腫瘤篩查和診斷具有重要的臨床價(jià)值。但微量的循環(huán)腫瘤特異性 sEV 和腫瘤異質(zhì)性等因素的限制著 sEV 的應(yīng)用, sEV 分子譜在肺結(jié)節(jié)良惡性鑒定診斷的應(yīng)用仍在探索中。
本研究通過開發(fā)了一種非侵入性的、基于血液樣本的解碼腫瘤特異性 sEVs 的分子譜技術(shù)(DECODE)用于肺癌良惡性鑒別診斷,表明 DECODE 芯片有望成為一種新型肺癌篩查工具,具有鑒別肺結(jié)節(jié)良惡性的潛在價(jià)值。
試驗(yàn)方法
研究者選擇了肺癌相關(guān) sEV 標(biāo)志物(THBS2、VCAN 和 TNC),首先利用 TNC 用于 sEV 捕獲,用抗 TNC 抗體將肺癌 sEV 濃縮捕獲在納米陣列上,然后通過基于納米盒的 SERS 條形碼讀取 THBS2、VCAN、TNC 和 CD63 的表達(dá),以此方法對(duì) sEV 的表型分析用于區(qū)分肺部良惡性病變。
主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果
01 DECODE 表型 sEV 分析
為了建立和研究細(xì)胞系 sEV 芯片(DECODE)在肺癌篩查的有效性,研究者首先分析肺癌細(xì)胞系相關(guān) sEVs 的物理學(xué)和生物學(xué)特征,結(jié)果顯示:肺癌細(xì)胞系來源 sEVs 具有相似的物理特征,但不同肺癌相關(guān)細(xì)胞系之間 sEVs 的蛋白質(zhì)表達(dá)水平呈現(xiàn)差異。
sEV 的表達(dá)水平特征差異 研究者接下來評(píng)估了肺癌相關(guān)特定 sEVs(CD63、THBS2、VCAN 和 TNC)分子譜用于區(qū)分肺結(jié) 節(jié)良惡性診斷能力。利用 DECODE 將四種顏色(紅、綠、紫、青)對(duì)應(yīng)上述四種相關(guān)標(biāo)記物的表達(dá),在藍(lán)色網(wǎng)格上顯示共聚焦 SER 圖像,結(jié)果顯示:在三種肺癌細(xì)胞 系相關(guān) sEVs 中 CD63、THBS2、VCAN 和 TNC 高表達(dá),在 SER 圖像顯示了豐富的結(jié)果,而在正常支氣管上細(xì)胞(HBEC)及對(duì)照組(PBS)呈現(xiàn)低 / 可忽略的表達(dá)水平。 表明 DECODE 芯片在檢測(cè)肺癌相關(guān) sEV 方面具有很高的特異性,可以顯示肺癌相關(guān) sEV 分子譜的潛能,因此可以生成肺癌患者篩查 sEV 分子譜從而進(jìn)行良惡性診斷。
02 DECODE 芯片診斷效能評(píng)估
研究者證明了 DECODE 芯片在 sEV 分子譜中特異度和靈敏度優(yōu)勢(shì)后,接著使用 DECODE 芯片通過來自 33 份患者(包括惡性肺結(jié)節(jié)患者、良性結(jié)節(jié)患者和健康人群)的血漿樣本的 sEV 分子譜分析 4 種標(biāo)記物的表達(dá)差異,以此實(shí)現(xiàn)對(duì)患者肺結(jié)節(jié)的良惡性診斷。研究者利用 SERS 作圖,并計(jì)算每個(gè)表面生物標(biāo)志物激活的柱子以獲得 sEV 分子譜,根據(jù)惡性結(jié)節(jié)在 sEV 分子圖譜通常顯示出 4 種生物標(biāo)志物的相對(duì)較高水平,而良性結(jié)節(jié)和健康對(duì)照組的 sEV 分子譜分別顯示較低和可忽略的生物標(biāo)記物表達(dá)的理論,研究結(jié)果顯示: 惡性結(jié)節(jié)的 sEV SERS 圖像顯示了四種顏色的高比例發(fā)光柱子,表明 CD63、THBS2、VACAN 和 TNC 呈現(xiàn)高表達(dá)。相反,良性結(jié)節(jié)和健康者的 sEV SERS 圖像顯示發(fā)光柱子相比要少得多。此外,與視覺 SERS 圖像一致, sEV 分子圖譜定量同樣顯示惡性結(jié)節(jié)的活性柱子百分比高于良性結(jié)節(jié)和健康者,表明 DECODE 芯片顯示 sEV 分子譜具有鑒別良惡性肺結(jié)節(jié)的能力。 研究者對(duì) DECODE 芯片區(qū)分結(jié)節(jié)良惡性的診斷表現(xiàn)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)評(píng)估,通過二元 Logistic 回歸分析方法進(jìn)行診斷效能定量評(píng)估,結(jié)果顯示: DECODE 芯片在區(qū)分良惡性結(jié)節(jié)患者中,受試者工作特征曲線(ROC)曲線下面積(AUC)為 0.85, 提示 sEV 分子譜在區(qū)分良惡性結(jié)節(jié)方面具有一定的應(yīng)用價(jià)值; 在區(qū)分惡性結(jié)節(jié)和健康受試者中, ROC 曲線的 AUC 為 1, 表明所生成的 sEV 分子譜對(duì)篩查健康人群中的惡性肺結(jié)節(jié)具有很高的診斷性能。上述結(jié)果顯示: 肺癌相關(guān)特異 sEV 分子圖譜具有識(shí)別惡性、良性肺結(jié)節(jié)的潛力。
總結(jié)
該研究開發(fā)了并驗(yàn)證了一種數(shù)字化 sEV 納米技術(shù)為平臺(tái),基于腫瘤相關(guān) sEV 特定的分子譜表型分析來區(qū)分良惡性病灶的診斷方法,在肺癌篩查領(lǐng)域中具有潛在的診斷價(jià)值,但有必要在更大隊(duì)列樣本中開展進(jìn)一步的臨床驗(yàn)證。 當(dāng)前在肺癌早篩領(lǐng)域中,通過多組學(xué)結(jié)合液體活檢技術(shù)的新型檢測(cè)開展多維度、多領(lǐng)域分析,在早期診斷領(lǐng)域中正發(fā)揮著巨大的臨床作用,提高了檢出率。尤其值得注意的是, 泰萊生物將 cfDNA 羥甲基化、血液中代謝物質(zhì)、胸部 CT 等項(xiàng)目納入基于多組學(xué)的肺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷產(chǎn)品,構(gòu)建出了多組學(xué)的融合模型,并已取得目前我國該領(lǐng)域內(nèi)大(獲病理診斷結(jié)果)規(guī)模的臨床研究隊(duì)列,為腫瘤的診療開辟出一條新的途徑。 多組學(xué)是全新的生物學(xué)分析方法,也是醫(yī)學(xué)界前沿的研究領(lǐng)域。
基于基因組、表觀組、蛋白組、代謝組、微生物組等多個(gè)不同生命環(huán)節(jié)、不同維度的大量分子水平生物數(shù)據(jù),利用生物信息統(tǒng)計(jì)分析、計(jì)算生物以及機(jī)器學(xué)習(xí)等技術(shù),以實(shí)現(xiàn)對(duì)生命過程、疾病等集合超多影響因子的復(fù)雜生命現(xiàn)象進(jìn)行高層次的分析、解讀,以此應(yīng)用于腫瘤篩查、腫瘤輔助診斷及腫瘤術(shù)后、預(yù)后評(píng)價(jià)指標(biāo)。
經(jīng)過分析萬例臨床肺結(jié)節(jié)患者胸部 CT、血液中代謝物質(zhì)及 cfDNA 羥甲基化水平數(shù)據(jù), MISSION 計(jì)劃構(gòu)建出了肺結(jié)節(jié)診斷多組學(xué)融合模型 ,并以此轉(zhuǎn)化了斐盼安®(影像組學(xué) + 代謝組學(xué))、斐盼康®(影像組學(xué) + 代謝組學(xué) + 表觀基因組學(xué))兩款產(chǎn)品,可對(duì)肺結(jié)節(jié)良惡性鑒別提供高效、可靠的參照,針對(duì)早期肺癌臨床診療,包括肺癌早篩、早診、性質(zhì)判定、手術(shù)決策、預(yù)后評(píng)估等任務(wù)的優(yōu)化與完善可起到相當(dāng)?shù)淖饔谩?早期發(fā)現(xiàn)并識(shí)別惡性肺結(jié)節(jié)患者是降低肺癌死亡風(fēng)險(xiǎn)的重要預(yù)防措施。盡管病理是診斷“金標(biāo)準(zhǔn)”,但支氣管鏡或穿刺活檢等侵入性方法并不能用于肺結(jié)節(jié)的常規(guī)篩查和監(jiān)測(cè)。
更為重要的是,當(dāng)肺結(jié)節(jié)良惡性評(píng)估缺乏高效、判斷方法時(shí),還可能會(huì)引發(fā)過度診斷、過度治療、占用醫(yī)療資源、增加患者經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)等各種問題。 液體活檢的方式具有非侵入性、便攜、快速等優(yōu)勢(shì),為了提高肺癌篩查的準(zhǔn)確性以及篩查方式的可及性、普適性,該種經(jīng)濟(jì)高效的新型監(jiān)測(cè)方法在腫瘤早期診斷中正發(fā)揮著廣泛的運(yùn)用價(jià)值。不論是本文中分享的 DECODE 芯片,還是泰萊生物開發(fā)落地的基于多組學(xué)的肺結(jié)節(jié)良惡性輔助診斷檢測(cè)產(chǎn)品,相信未來還會(huì)有更多前沿科技,能夠應(yīng)用于肺結(jié)節(jié)及早期肺癌篩查,幫助民眾向?qū)崿F(xiàn)癌癥 “防大于治” 邁進(jìn)。