骨骼肌組織是人體中大的組織之一,其對(duì)人體的運(yùn)動(dòng)功能有著至關(guān)重要的作用。骨骼肌受損后,有自我恢復(fù)的功能。這包括了靜止的肌肉干細(xì)胞(Muscle stem cells)的激活,免疫細(xì)胞的浸潤(rùn)與炎癥反應(yīng)等。這種恢復(fù)過程的詳細(xì)機(jī)理,還不為人所知。Nakka et al. 發(fā)現(xiàn)肌肉干細(xì)胞通過JMJD3的去甲基化活性表觀遺傳調(diào)控了透明質(zhì)酸(又名,玻尿酸)的合成,從而克服了損傷環(huán)境中的抑制性炎癥因子的作用,從而退出靜止并啟動(dòng)修復(fù)。
肌肉損傷后,肌肉干細(xì)胞表現(xiàn)出不同水平的表觀遺傳學(xué)改變。而肌肉干細(xì)胞退出靜止(quiescence)則伴隨著組蛋白H3賴氨酸27甲基化(H3K27me3)的全局下調(diào) 【2】。
作者發(fā)現(xiàn)同屬KDM6去甲基化酶蛋白家族的UTX與JMJD3在包括靜止的肌肉干細(xì)胞的各類細(xì)胞類型中廣泛表達(dá)。隨后,構(gòu)建了泰莫西芬(tamoxifen)誘導(dǎo)的Utx或Jmjd3特異性敲除肌肉干細(xì)胞系。通過心臟毒素(cardiotoxin)在上述細(xì)胞系與野生型細(xì)胞中誘發(fā)急性細(xì)胞損傷,觀察其修復(fù)與纖維再生,作者確定了JMJD3在肌肉細(xì)胞纖維再生過程中起重要作用。失去去甲基化酶活的JMJD3無法使得肌肉干細(xì)胞重新進(jìn)入細(xì)胞周期,纖維再生能力降低,這與JMJD3敲除細(xì)胞系表型類似。
有趣的是,在未受損傷的肌肉細(xì)胞中,哪怕缺失了JMJD3,肌肉細(xì)胞仍然可以被修復(fù)。而在小鼠實(shí)驗(yàn)中,單側(cè)腿的脛骨前肌受到損失,對(duì)側(cè)腿的肌肉修復(fù)過程在JMJD3敲除條件下也會(huì)被抑制。這說明存在一種可溶性的因子,會(huì)在肌肉細(xì)胞受損后被釋放,并抑制相關(guān)的肌肉修復(fù)過程。而JMJD3的作用是克服該因子的抑制作用,使得肌肉干細(xì)胞重新進(jìn)入周期,開啟修復(fù)。
為了進(jìn)一步闡明JMJD3在細(xì)胞損傷修復(fù)過程中的作用機(jī)理,作者需要回答兩個(gè)問題。一,這種因子是什么?二,JMJD3是如何克服該因子的抑制作用的?作者使用了包括基因探針富集分析(Gene set enrichment analysis),基因組與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析等一系列生物信息學(xué)方法,結(jié)合小鼠實(shí)驗(yàn),回答了上述問題。
作者發(fā)現(xiàn)干擾素γ(interferon- γ)、白細(xì)胞介素6(interleukin-6)在受損肌肉細(xì)胞環(huán)境中得到上調(diào)。體外實(shí)驗(yàn)證明該兩種因子可以抑制肌肉干細(xì)胞進(jìn)入細(xì)胞周期。在損傷后微環(huán)境中出現(xiàn)的巨噬細(xì)胞和中心粒細(xì)胞,則有可能是這些炎癥因子的來源 【1、3】。
為了找到JMJD3的調(diào)控對(duì)象,作者設(shè)置了三條篩選標(biāo)準(zhǔn):1)在JMJD3敲除細(xì)胞系中表達(dá)量下調(diào),2)啟動(dòng)子2500bp內(nèi)有JMJD3結(jié)合位點(diǎn),以及3)JMJD3敲除后該基因附近區(qū)域有H3K27me3的富集。有41個(gè)基因滿足上述條件。
基于此,作者特別關(guān)注的是一個(gè)編碼參與透明質(zhì)酸(hyaluronic acid)合成的酶的基因Has2。透明質(zhì)酸是細(xì)胞外基質(zhì)的組成部分,并且參與眾多信號(hào)通路的調(diào)控 【4】。作者發(fā)現(xiàn)損傷后40小時(shí)在野生型細(xì)胞周圍有透明質(zhì)酸包裹,而在JMJD3敲除細(xì)胞系則觀察不到該特征。當(dāng)用化學(xué)抑制劑阻斷透明質(zhì)酸的合成時(shí),野生型細(xì)胞的損傷修復(fù)也別抑制了。另一方面,在JMJD3敲除型細(xì)胞中加入額外的透明質(zhì)酸,可以誘導(dǎo)其重新進(jìn)入細(xì)胞周期并啟動(dòng)修復(fù)。
綜上,炎癥因子干擾素γ與白細(xì)胞介素6抑制了肌肉干細(xì)胞退出靜止的過程,而Has2依賴JMJD3的去甲基化作用而得到激活,產(chǎn)生的透明質(zhì)酸整合進(jìn)受損細(xì)胞的細(xì)胞外基質(zhì)中,使得肌肉干細(xì)胞能克服炎癥因子的抑制作用重新進(jìn)入細(xì)胞周期,并啟動(dòng)修復(fù)。