中科院上海生科院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(上海)吳立剛研究組與上海市計劃生育研究所施惠娟研究組合作,優(yōu)化建立了適用于微量樣本的小RNA深度測序文庫構(gòu)建方法,并系統(tǒng)解析了小鼠早期胚胎發(fā)育過程中小RNA的動態(tài)變化及其生物學(xué)功能。相關(guān)研究成果日前在線發(fā)表于《科學(xué)進展》。
目前小RNA深度測序的文庫構(gòu)建通常要幾百納克總RNA,研究配子和胚胎等難以大量獲取的生物學(xué)樣品中的小RNA表達譜較為困難。研究人員通過優(yōu)化基于連接反應(yīng)的小RNA文庫構(gòu)建方法,使得總RNA用量降為幾十分之 一,僅需要10納克總RNA即可實現(xiàn)對小RNA的深度測序,為研究配子、胚胎和各種干細胞中的小RNA提供了重要技術(shù)支撐。
研究人員還利用優(yōu)化的方法系統(tǒng),不僅揭示了小鼠早期胚胎發(fā)育中miRNA的表達和降解規(guī)律,還發(fā)現(xiàn)了miRNA對靶基因的調(diào)控活性隨著胚胎發(fā)育而被動態(tài)調(diào)控的現(xiàn)象,對于理解miRNA在早期胚胎發(fā)育中的功能和機制具有重要意義。