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英開發(fā)IntClust系統(tǒng)改善乳腺癌治療

文章來源:生物通發(fā)布日期:2014-09-09瀏覽次數(shù):15955

  近,英國科學(xué)家們開發(fā)出一種新的工具,可以將乳腺癌分為十種不同的亞型,有望改善這種疾病的治療效果。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2014年8月28日的《Genome Biology》雜志。
  癌癥的發(fā)生,是因?yàn)檫z傳變化使正常細(xì)胞發(fā)展為腫瘤。隨著對(duì)乳腺癌了解的增多,我們知道,這不是一種單一的疾病——引起不同類型癌癥的基因突變是不一樣的,這就是為什么腫瘤對(duì)治療的反應(yīng)有差異,為什么它們會(huì)以不同的速度生長。目前,臨床醫(yī)生預(yù)測(cè)治療療效有兩個(gè)關(guān)鍵的指標(biāo)。
  發(fā)現(xiàn)腫瘤遺傳學(xué)的研究動(dòng)態(tài),并創(chuàng)建一種系統(tǒng)來診斷腫瘤類型,是癌癥科學(xué)家們的一個(gè)主要目標(biāo)。為此,英國癌癥研究所和劍橋大學(xué)的研究人員,開發(fā)了IntClust系統(tǒng),該系統(tǒng)利用基因組技術(shù)來創(chuàng)建一種分類系統(tǒng),該分類系統(tǒng)具有足夠的細(xì)節(jié),能夠更準(zhǔn)確地指出患者得的是哪種類型的乳腺癌,從而確定哪種治療方法將是合適的。
  為了檢測(cè)這個(gè)系統(tǒng),科學(xué)家們分析了他們開發(fā)系統(tǒng)所用的997份腫瘤樣本,以及來自公共數(shù)據(jù)庫的7544份樣本,連同基因組和臨床數(shù)據(jù),包括來自The Cancer Genome Atlas的數(shù)據(jù)。他們使用IntClust系統(tǒng)和今天使用的兩個(gè)主要系統(tǒng):PAM50,其將癌癥分成五種類型;和SCMGENE,其將癌癥分成4種類型,對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行分類。
  他們發(fā)現(xiàn),至少在預(yù)測(cè)患者預(yù)后和治療療效方面,IntClust與現(xiàn)有的系統(tǒng)無異。但是這個(gè)系統(tǒng)只在3.1%具有較差存活率的女性當(dāng)中,識(shí)別出一個(gè)以前沒有注意到的子群,這些患者似乎對(duì)治療具有抵抗性。識(shí)別這一患者組的基因組標(biāo)簽,就能夠在早期標(biāo)記這些高風(fēng)險(xiǎn)的癌癥,獲得這一組患者的基因組數(shù)據(jù),就可能有助于研究新的方法,治療這種類型的癌癥。
  目前,利用該系統(tǒng)對(duì)腫瘤進(jìn)行分類,對(duì)于大多數(shù)臨床醫(yī)生還是昂貴的,并且,解釋這些結(jié)果也需要許多臨床設(shè)置達(dá)不到的訓(xùn)練。但是,這一系統(tǒng)的細(xì)節(jié)和精度,可能對(duì)乳腺癌研究人員具有廣泛的用處,它們將能夠調(diào)查某類癌癥對(duì)某些治療方法反應(yīng)較好的原因,以便尋找乳腺癌的臨床標(biāo)記,或發(fā)現(xiàn)其新的治療靶點(diǎn)。