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Caliper公司推出了LabChip? XT自動化的核酸回收儀器

文章來源:電子資訊發(fā)布日期:2011-02-10瀏覽次數(shù):58166

 新一代測序的速度是越來越快了,費用也在不斷降低,但整個流程中還有不少瓶頸,限制了它的通量。耗時的任務之一就是在文庫制備過程中對打斷的基因組DNA進行基于凝膠的大小篩選。除了耗勞力和不易擴展之外,這種手工的方法還會引入不同運行之間、不同操作員之間的差異。此外,手工操作也不是很準確,通常會有10%的誤差,比如400 bp + 40 bp。

  為了消除這個關(guān)鍵的瓶頸,提高新一代測序技術(shù)的文庫制備效率,Caliper公司推出了LapChip XT,一種自動化的核酸回收儀器。它是由Caliper與的測序中心共同開發(fā)的,也是Caliper向測序市場推出的個產(chǎn)品。

  基于前沿的Lab-on-chip技術(shù),LabChip XT利用多通道的一次性芯片,能在30分鐘內(nèi)自動完成多達4個樣品(PCR產(chǎn)物、smear均可)的電泳-目標片段分離-回收,液相產(chǎn)物可直接用于下游步驟。這種獨特的設計排除了交叉污染的可能性,為分析和定量提供了數(shù)字數(shù)據(jù)。此平臺的得率高、準確可重復,且無污染之憂,適合各種測序平臺,更可拓展至常規(guī)膠回收實驗及蛋白樣品。

  只需5個步驟,即可完成目標片段的回收。首先將樣品上樣到芯片上,然后將芯片放置在儀器中。條形碼閱讀器識別芯片和分析。選擇抽提的片段大小。從5種不同的收集模式中選擇。軟件自動進行篩分和抽提。之后即可取出樣品,立即進行下游分析。

  此平臺對于新一代測序用戶而言可謂福音,因此Illumina也在早些時候與Caliper簽下了共同推廣協(xié)議,讓Genome Analyzer和HiSeq 2000的用戶能夠減少手工操作,更準確更高通量地進行樣品分析和篩分,并改善數(shù)據(jù)質(zhì)量和樣品間的一致性。

  除LabChip XT外,Caliper還開發(fā)出一整套新一代測序工具。LabChip GX利用Caliper創(chuàng)新的微流體技術(shù)開展高分辨率的電泳分離,以分析DNA或RNA的大小、濃度和完整性。Zephyr Genomics核酸工作站讓核酸抽提及其他標準的分子生物學步驟自動化。而Sciclone NGS工作站能在4-6小時完成8-96個高質(zhì)量文庫的制備。

  Caliper科技公司是芯片實驗室技術(shù)的。Caliper設計、制造及推動LabChip設備和系統(tǒng)的商品化。通過芯片實驗室技術(shù),科學家可以在一個小芯片上進行試驗,而這在過去則要求使用全套實驗室設備和人員才能完成。這個芯片非常小,它包含一個由許多用顯微鏡才能看見的通道構(gòu)成的網(wǎng)絡,液體和化學物質(zhì)通過這些通道流動,以完成實驗。LabChip系統(tǒng)簡化和加快了實驗室試驗過程,有望應用于非常廣泛的行業(yè)中,包括制藥、農(nóng)業(yè)、化工和診斷。