研究團隊通過多維 CRISPR-Cas9 基因篩選,用多個線粒體自噬報告系統(tǒng)和促線粒體自噬觸發(fā)物,鑒定了多個 parkin 依賴線粒體自噬成分。并意外地發(fā)現(xiàn),在多種細胞類型中 ANT 復(fù)合體對線粒體自噬是不可或缺的。在體外,藥理抑制 ANT 介導(dǎo)的 ADP/ATP 交換作用促進線粒體自噬,然而,ANT 基因切除卻反常地抑制自噬。重要的是,ANT 促進線粒體自噬并不依賴于其核苷酸轉(zhuǎn)移酶的催化活性。需要 ANT 復(fù)合物抑制前序列轉(zhuǎn)移酶 TIM23,從而維持 PINK1 穩(wěn)定,響應(yīng)生物能量崩潰,其中,ANT通過與 TIM44 相互作用間接調(diào)節(jié) TIM23,調(diào)控是通過 TIM23 調(diào)節(jié)肽導(dǎo)入。在體內(nèi),缺少 ANT1 小鼠表現(xiàn)出線粒體自噬鈍化,從而導(dǎo)致線粒體異常積累。疾病導(dǎo)致的人類 ANT1 突變使其不能結(jié)合 TIM23,并抑制線粒體自噬??傊?,ANT 是線粒體自噬本質(zhì)和基礎(chǔ)的調(diào)節(jié)因子。
多維度的 CRISPR-Cas9 基因篩選
在主要自噬途徑, PINK1 積聚在損傷的線粒體,募集 E3 泛素連接酶 Parkin 靶向線粒體導(dǎo)致自噬。將穩(wěn)定過表達 Parkin 的幾種小鼠成肌細胞分別暴露于兩個應(yīng)激源—— 膜電位解偶聯(lián)劑 CCCP (購于 MedChemExpress) 或抑制氧化磷酸化的 OAR 試劑盒,進行多維 CRISPR–Cas9 全基因組篩選,發(fā)現(xiàn):在多種細胞系中,Parkin 介導(dǎo)的線粒體自噬需要 ANT。
ANT 促進細胞吞噬不依賴于ADP / ATP交換活性
ANT 位于線粒體內(nèi)膜上,介導(dǎo) ADP 和 ATP 的跨膜交換,向線粒體 ATPase 提供 ADP 。藥理性抑制 ADP / ATP 的交換作用加劇了線粒體自噬。然而,盡管 Ant1 或Ant2 基因的缺失加劇 CCCP 誘導(dǎo)的膜極化,卻反常地抑制了線粒體自噬,因此,ANT 是通過其他機制抑制了線粒體自噬。ADP/ATP 交換相關(guān)突變 Ant1 (K43E/R244E) 能有效挽救線粒體自噬,保留 ADP/ATP 交換的疾病突變體 Ant1 (A90D),ANT1 (A123D) 不起作用。因此,ANT 促進線粒體自噬不依賴于ADP/ATP 交換活性。
ANT 的缺失抑制 PINK1 依賴的氧化應(yīng)激以及氧化磷酸化毒性引起的線粒體自噬,表明 ANT 在 PINK1 的上游起作用。正常情況下,PINK1 會被胞質(zhì)蛋白酶體組成型降解。但當線粒體受損后,TIM23 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)運被抑制,使 PINK1 逃逸降解,并將 Parkin 募集到線粒體。ANT1 或者 ANT2 缺失時,CCCP 不能誘導(dǎo) PINK1 保持穩(wěn)態(tài),而野生型、K43E/R244E 突變型的 ANT1 維持 PINK 的穩(wěn)態(tài)。相比之下,CCCP 觸發(fā)的 TIM23 介導(dǎo)的蛋白易位到基質(zhì)中的抑制和 Su9-DHFR 前體的裂解減弱,表明 ANT1 或 ANT2 是抑制 TIM23 所必需。此外,ANT1 和 ANT2,ANT1(K43E/R244E) 都能與 TIM23 的相互作用,且 ANT1 (K43E/R244E) 還能抑制 TIM23,但 ANT1(A90D) 和 ANT1(A123D) 均不能。綜上,ANT 通過與 TIM23 相互作用,抑制 TIM23 轉(zhuǎn)錄酶響應(yīng)生物能崩潰,與 TIM23 作為 ADP/ATP 交換載體的活性無關(guān)。
ANT 通過 TIM44 介導(dǎo) TIM23 的抑制
TIM44 是 TIM23 復(fù)合物的基質(zhì)側(cè)組分,其控制多肽跨 TIM23 的轉(zhuǎn)運。TIM44 敲除結(jié)果表明 TIM44 可能介導(dǎo) TIM23-ANT1 的相互作用。TIM44 的丟失使線粒體吞噬和 PINK1 積累都變鈍。ANT1 (G146E/K147D) 不能在缺少 ANT1 的細胞中挽救線粒體自噬,但致病突變體 ANT1(A90D)也破壞了與 TIM44 的相互作用。相反, TIM44 (K282D) 盡管保留了與 TIM23 自身結(jié)合的能力,但無法挽救缺少 TIM44 的細胞的線粒體自噬。綜上數(shù)據(jù)表明,ANT1 與 TIM23 介導(dǎo)的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運調(diào)節(jié)因子 TIM44 相互作用,而 ANT1 與 TIM44 的相互作用是 ANT1-TIM23 相互作用、抑制 TIM23 介導(dǎo)的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運以應(yīng)對生物能量崩潰和促進有絲分裂的必要條件。
體內(nèi)線粒體自噬依賴 ANT1
Ant1 缺失小鼠 (Ant1KO mice) 的大腦和心臟線粒體自噬減弱,無論在轉(zhuǎn)錄組水平相同或者更高的情況下,PINK1 和 Pakin 的積累都比控制組減少。觀察發(fā)現(xiàn),Ant1KO 小鼠的骨骼肌發(fā)生線粒體自噬嚴重缺陷。輕度肌肉疾病導(dǎo)致喪失 ADP/ATP 交換能力的患者,能通過重新表達野生型 Ant1 或者是 K33Q 缺陷 Ant1 都能恢復(fù)線粒體自噬,然而重度疾病 ADP/ATP 交換正?;颊咧斜磉_ ANT1 (A90D) 仍不能恢復(fù)自噬,這與 Ant1KO 小鼠線粒體和線粒體 DNA 的堆積結(jié)果一致。值得注意的是,核編碼的線粒體基因并未受到影響。缺乏 ANT1 引起了線粒體自噬功能喪失,在一名攜帶 ANT1 純合功能缺失突變患者的臨床癥狀以及線粒體觀察中得到驗證。