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憑基因組數(shù)據(jù)識(shí)別人臉,不靠譜

文章來源:科技日?qǐng)?bào)發(fā)布日期:2017-09-16瀏覽次數(shù):957

 能否根據(jù)基因組預(yù)測(cè)人類相貌引發(fā)業(yè)界專家激烈爭(zhēng)論。圖片來源:nature網(wǎng)站

克萊格·文特爾是美國頗有影響力的生物學(xué)家,雖說不是畢業(yè)于所謂的大學(xué),但他的每一次研究舉動(dòng),總會(huì)在業(yè)界帶來颶風(fēng)般的影響。比如他曾成立公司公然挑戰(zhàn)30億美元人類基因組計(jì)劃,宣稱會(huì)用3.3億美元搶先一步公布人類基因組圖譜,迫使人類基因組計(jì)劃提前2年完成;他的研究團(tuán)隊(duì)在實(shí)驗(yàn)室制造出世界人造生命……
近日,文特爾創(chuàng)辦的一家公司宣布,他們的新研究認(rèn)為,DNA數(shù)據(jù)會(huì)通過相貌和身體特征泄露匿名者的真實(shí)身份,再次引來其他科學(xué)家們的質(zhì)疑和批評(píng)。
據(jù)《自然》雜志網(wǎng)站近日?qǐng)?bào)道,他創(chuàng)辦的人類長壽公司(HLI)的科研團(tuán)隊(duì)在《美國科學(xué)院學(xué)報(bào)》發(fā)表論文建議,法律制定機(jī)構(gòu)、科學(xué)家和其他相關(guān)人員,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)人類基因組數(shù)據(jù)的監(jiān)管,防止因DNA數(shù)據(jù)外泄而暴露個(gè)人隱私。
但來自賓夕法尼亞大學(xué)和哥倫比亞大學(xué)等機(jī)構(gòu)的知名科學(xué)家卻質(zhì)疑稱,文特爾團(tuán)隊(duì)的研究夸大了基因識(shí)別人們身份的能力,會(huì)引起社會(huì)對(duì)基因隱私的不必要的恐慌。更有參與研究的內(nèi)部人士表示,文特爾此舉存在私人目的,他可能在利用自己的影響力,改變目前基因數(shù)據(jù)公開獲取的現(xiàn)狀,利用自己的基因數(shù)據(jù)庫謀取利益。
研究結(jié)論或過度夸大
文特爾團(tuán)隊(duì)發(fā)表論文稱,他們對(duì)不同年齡和種族背景的1061位志愿者進(jìn)行了全基因組測(cè)序,結(jié)合對(duì)這些參與者面部拍攝的高清晰度3D照片,他們開發(fā)出的人工智能軟件能基于DNA序列的SNPs(單核苷酸多態(tài)性)識(shí)別出臉頰骨高度等面部特征,并發(fā)現(xiàn)一個(gè)人SNPs隱含著其身高、體重、年齡、口音和膚色等個(gè)性化特征。結(jié)果證明,利用他們的方法和HLI的DNA數(shù)據(jù)庫,從隨機(jī)選出的10個(gè)人中識(shí)別出某個(gè)人的準(zhǔn)確率高達(dá)74%。
在仔細(xì)研讀文特爾團(tuán)隊(duì)的論文后,許多遺傳學(xué)家提出了質(zhì)疑,認(rèn)為研究結(jié)論存在夸大事實(shí)嫌疑。賓夕法尼亞大學(xué)人類學(xué)家馬克·施萊弗認(rèn)為,這篇論文并沒有證明僅靠DNA數(shù)據(jù)就能準(zhǔn)確辨別某個(gè)人的隱私,因此文中提出的風(fēng)險(xiǎn)并不存在,而且自由選擇10個(gè)人,規(guī)模這么小的樣本,依靠年齡、性別和種族這些數(shù)據(jù)就可以完全將這些人區(qū)別開來,根本不需動(dòng)用DNA數(shù)據(jù)。
為進(jìn)行有力反駁,哥倫比亞大學(xué)計(jì)算機(jī)生物學(xué)家雅尼夫·埃里希重新對(duì)論文中提到的年齡、性別和種族數(shù)據(jù)進(jìn)行了模擬研究,并在預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv發(fā)表了研究結(jié)果,不必知道這些人的任何基因組信息,僅依靠這3個(gè)特征就足以將某個(gè)人從10人中區(qū)別出來,準(zhǔn)確率高達(dá)75%。他還推斷,HLI利用SNPs數(shù)據(jù)重構(gòu)的面部特征并不能準(zhǔn)確指向某個(gè)人,只是與性別和種族等特征的某類人接近而已。
《科學(xué)》雜志曾拒發(fā)論文

施萊弗稱,論文發(fā)表在《美國科學(xué)院學(xué)報(bào)》之前,文特爾團(tuán)隊(duì)曾將論文提交給《科學(xué)》雜志,他當(dāng)時(shí)參與這篇論文的同行審議。當(dāng)時(shí)評(píng)審團(tuán)認(rèn)為,雖然HLI的研究數(shù)據(jù)真實(shí)可靠,研究中通過對(duì)染色體兩端進(jìn)行測(cè)序來推斷測(cè)試者年齡的全新方法令人印象深刻,但論文并沒有像聲稱的那樣能通過DNA數(shù)據(jù)識(shí)別個(gè)人信息,研究結(jié)論存在故意歪曲傾向。
雖然論文署名作者中包括文特爾等重量級(jí)人物,但《科學(xué)》雜志終還是拒絕發(fā)表該論文。根據(jù)規(guī)定,作為美國科學(xué)院院士,文特爾有權(quán)自己選擇3位科學(xué)家對(duì)其論文進(jìn)行同行審議,通過后即可在《美國科學(xué)院學(xué)報(bào)》發(fā)表?!睹绹茖W(xué)院學(xué)報(bào)》承認(rèn)是文特爾自己選擇了兩位信息隱私方面的專家和一位生物倫理學(xué)家,評(píng)審?fù)ㄟ^了該論文。
HLI拒論文評(píng)審過程進(jìn)行評(píng)論,只是在一份聲明中表示,雖然設(shè)置的研究樣本規(guī)模過小,但研究中的方法學(xué)完全沒有問題,基于一千個(gè)左右參與者的基因組數(shù)據(jù)庫,識(shí)別一個(gè)人完全可能做到,并且這種識(shí)別將會(huì)越來越準(zhǔn)。
強(qiáng)調(diào)基因組隱私或?yàn)榻?jīng)濟(jì)目的
論文作者之一、現(xiàn)在蘋果公司工作的計(jì)算機(jī)生物學(xué)家杰森·派珀承認(rèn),由于他已經(jīng)跟HLI簽訂同意書,放棄論文發(fā)表前簽名同意的權(quán)利,從而讓HLI按照公司意愿對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行陳述,論文歪曲了他和其他同事的研究結(jié)果。
派珀通過推特對(duì)論文進(jìn)行了嚴(yán)厲批評(píng),認(rèn)為HLI這樣做存在利益考量。由于現(xiàn)行制度規(guī)定,所有用于研究的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)必須能公開獲取,但作為盈利為目的的公司,HLI希望能建造世界上大的人類遺傳信息數(shù)據(jù)庫,并以保護(hù)個(gè)人隱私為借口,游說政策制定部門對(duì)DNA數(shù)據(jù)庫設(shè)置各種限制條件,將這些數(shù)據(jù)作為公司賺錢的工具。“保護(hù)遺傳隱私非常重要,但為獲悉更多的基因組信息,人們必須共享所有相關(guān)數(shù)據(jù),為這種共享設(shè)置障礙的方法是背道而馳的?!迸社暾f。
雖然HLI一再聲明主張保護(hù)基因組信息的目的是促進(jìn)數(shù)據(jù)交換的安全性,但埃里希認(rèn)為,以文特爾的地位,這次的論文必將吸引更多政策制定者的關(guān)注,在決策中參考這類研究論文,制定出全新管理制度,阻礙人們?cè)谘芯恐泄蚕砘蚪M數(shù)據(jù)。