獲得完整的個人基因密碼序列,需要花費多少錢?35萬美元?這是去年冬季的價格。瑞士百萬富翁丹·斯多埃塞斯庫(Dan Stoicescu)選擇了以購買一輛賓利汽車的價格,得到了自己的基因圖譜。當時,丹·斯多埃塞斯庫很清楚,再過幾個月,這個價格就會像股票一樣大幅下跌。果不其然,據(jù)美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司上個月公布的報告,在未來的六個星期中,購買個人完整基因組圖譜只需要6萬美元。有科學家估計,在未來的三年中,這個價格甚至會降至1000美元。不過,科學家似乎對這個結(jié)果仍然不甘心,他們的目標是——100美元,相當于一條牛仔褲的價格。
五年后,100美元
“在十年前,人們可能還會覺得我們的這個項目只是科幻電影。”瑞多基·德芒納克(Radoje Drmanac)是美國完整染基因公司(Complete Genomics)的首席科學家,該公司位于加利福尼亞山景城(Mountain View, CA)。他所說的項目,正是這個讓人花100美元就能了解自己遺傳密碼的工程。在整個項目的研究中,完整染色體組公司得到了生物納米矩陣公司(BioNanomatrix)的納米技術(shù)支持。他們正在全力開發(fā)的快速基因測序方法,能在24小時內(nèi)完整讀取個人基因圖譜。盡管這個讓基因測序變得平民化的夢想,至少還需要五年的時間去實現(xiàn),但瑞多基·德芒納克他們?nèi)匀粚Υ顺錆M了信心。
說到技術(shù)層面,瑞多基·德芒納克所采用的技術(shù),與要在三年內(nèi)實現(xiàn)1000美元完整基因組測序的美國基因公司(US Genomics)基本上屬于同一種思路。其核心在于一種名為“納米流體”(Nanofluidic)的芯片。在這種比一片手指甲還小的芯片里,納米級的流體拖曳出DNA分子長鏈,讓其中的分子徐徐展開,通過像保齡球瓶一樣排列的管道中。這時芯片會取一個基因組作為參考,用熒光標記被測DNA鏈中與參考基因組不同的堿基對。DNA鏈通過管道時,探測器就順勢讀取這些用熒光做過標記堿基對的順序。然后,添上與參考基因組相同的堿基對,就完成了成為整個基因的序列。這種快速方法每分鐘可以測序大約200000個堿基對。
目前,提供多數(shù)基因測序的生物科技公司采用的測序方法,都是根據(jù)1977年由“基因狂人”克雷格·文特爾(Craig Venter)發(fā)明的“全基因組鳥槍法測序”發(fā)展而來。這種化學測序方法又被稱為“霰彈法”,需要把DNA長鏈切割成若干片段,對每個片段進行測序,然后用計算機把碎片序列重新拼接成整個DNA的序列。盡管,隨著計算機技術(shù)的飛速發(fā)展,測序設(shè)備的速度早已今非昔比,但這種方法每次仍然只能閱讀大約1000個堿基對,還需要費時費錢的準備和分析過程。用這種傳統(tǒng)測序方法,人類基因組的次測序耗費十多年,花費30億美元,直到2003年才初步完成。去年,DNA雙螺旋之父詹姆士·沃森(James Watson)也通過改良后的“鳥槍法”獲得了自己的基因圖譜,并付出了100萬美元。
不過,將基因圖譜看作品的觀念馬上就要過時了。越來越多的生物科技公司開始向人們提供完整基因測序服務(wù),按照目前的態(tài)勢發(fā)展,完整基因測序已經(jīng)成為一種商業(yè)行為。而縱觀其歷史發(fā)展軌跡,竟和計算機的普及過程頗有幾分相似。計算機剛誕生時,也讓人可望而不可即,而現(xiàn)在幾乎人手一臺,還是那種小巧的筆記本電腦。再看看現(xiàn)在電腦制造商的競爭激烈程度,這會不會也是未來基因組測序服務(wù)的景象?
基因的秘密
人們對于描繪自身完整基因圖譜的熱衷,并不是完全出于圖新鮮和看熱鬧。每個人都有了解自己的權(quán)利,每次基因,檢測人員都會從被檢測對象的血管中抽取三試管血,就在這些試管中,隱藏著人類了解自己秘密的鑰匙——基因。那么,基因到底對人們有著怎么樣的意義?
科學家在繪制出人類基因組圖譜后發(fā)現(xiàn),任意兩個不相關(guān)的個體的DNA序列有99.9%是一致的。就是說,人類所有的差別就包含在剩下的0.1%中。也就是這看似微不足道的0.1%,決定了每個人的外貌、性格傾向、能力、可能獲得某種疾病的概率以及其他種種特征,造成了人類社會的豐富性和復雜性。
對于醫(yī)療工作者來說,解開這0.1%差別的秘密,就能真正開啟個人醫(yī)療的時代,為病人度身定制醫(yī)療方案,精確地實現(xiàn)對癥下藥的目的。研究者發(fā)現(xiàn),在這0.1%的差別中,有90%的部分是由單個核苷酸的變異引起DNA序列多態(tài)性所導致的。雖然,人類單核苷酸的多態(tài)性會有所差別,但絕大部分的差別對人的表征沒有影響。而一旦這些由單核苷酸所引起的差別產(chǎn)生了影響,就有可能引起基因功能的改變,從而影響體內(nèi)蛋白質(zhì)的正常功能,或者在蛋白質(zhì)功能不變的情況下造成蛋白質(zhì)數(shù)量的改變。這些改變,將導致某一類人對某種疾病的抵抗能力減弱,某一類人對某種藥物特別敏感,而另一些藥卻對某一類人無效,某一類人的某項身體機能特別強或者特別弱。完全了解自己的基因組,破解這些身體的秘密,將有助于人類做好更多預(yù)防準備工作。不止是科學家的愿景——讓100美元基因組測序時代來得更快一些吧。