近期來自華中科技大學生命科學與技術(shù)學院的研究人員在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志(IF 7.8)上發(fā)表了題為“MicroRNA and transc[x]ription factor co-regulatory network analysis reveals miR-19 inhibits CYLD in T-cell acute lymphoblastic leukemia”的研究論文,報告了關(guān)于急性T淋巴細胞白血病中miRNA和轉(zhuǎn)錄因子共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的生物信息學研究的新成果。領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是華中科技大學生命科學與技術(shù)學院的郭安源教授,主要從事生物信息學和系統(tǒng)生物學在復(fù)雜疾病中的研究,包括數(shù)據(jù)整合、數(shù)據(jù)庫構(gòu)建、miRNA調(diào)控、比較基因組學和二代測序數(shù)據(jù)的分析研究等。
急性T淋巴細胞白血?。═-ALL)是一種進行性的血液系統(tǒng)惡性疾病,以高外周血細胞計數(shù)、原始細胞增多、中樞神經(jīng)系統(tǒng)浸潤和縱隔腫瘤為特征,好發(fā)于兒童和青少年。當淋巴母細胞(一種未成熟的白細胞)變成惡性、不受控制地增殖并迅速擴散至全身時,T-ALL便發(fā)生了。該疾病進展兇險,如果不進行治療,疾病在幾周內(nèi)就可致命。近年來盡管多藥聯(lián)合、大劑量化療等治療手段的不斷改進,以及各類造血干細胞移植的應(yīng)用和推廣,但是該病的總體療效和預(yù)后比更常見的B細胞系淋巴細胞白血病仍然要差很多。目前對于這一疾病發(fā)病的具體分子機理和調(diào)控機理還不清楚。
在這篇文章中,郭安源教授課題組以miRNA和轉(zhuǎn)錄因子的共調(diào)控角度為切入點,運用生物信息學方法,預(yù)測miRNA和轉(zhuǎn)錄因子與疾病基因之間形成的共調(diào)控前饋環(huán)模塊,并由此構(gòu)建共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。通過深入分析該調(diào)控網(wǎng)絡(luò)獲得了其中的核心miRNA和基因。并進一步對其中核心基因miR-19與CYLD在T-ALL中的分子機理進行了研究,揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的產(chǎn)生,繼而激活下游的NFKB信號通路,導(dǎo)致T淋巴細胞增殖失控。
這項研究成果從系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)水平研究急性T淋巴細胞白血病的發(fā)病機理和調(diào)控過程,為其診斷和治療提供理論依據(jù),并為復(fù)雜疾病的研究提供了計算和實驗交叉的新思路和方法。