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NVIDIA大幅提升醫(yī)療研究速度

文章來源:發(fā)布日期:2008-07-29瀏覽次數(shù):75076
斯坦福大學分布式計算項目Folding@home通過將數(shù)百萬顆處理器的強大計算性能應用在其蛋白質折疊模擬工作中,成為從事研究癌癥、囊腫性纖維化以及帕金森綜合癥等致命疾病治療手段隊伍中的一支重要力量。Folding@home項目是GPU(圖形處理器)越來越多地應用于非游戲領域的一個新例子。在NVIDIA GeForce GPU(圖形處理器)上運行Folding@home客戶端的實際結果表明,蛋白質折疊模擬工作的速度比當今的CPU快140倍。

  斯坦福大學化學系副教授兼Folding@home項目總監(jiān)Vijay Pande表示:“GeForce GPU(圖形處理器)對蛋白質折疊模擬的影響是巨大而深遠的。使用GeForce GPU(圖形處理器)來模擬蛋白質折疊的團隊實現(xiàn)了其生產效率的極速飆升。在Folding@home中應用如此強大的處理性能改變了這一項目,極大地縮短了我們進行生物醫(yī)學研究所需的時間。”

  為了處理盡可能多的數(shù)據,F(xiàn)olding@home項目聚集了大量組隊競賽的計算機發(fā)燒友。ExtremeOverclocking.com網站統(tǒng)計并顯示了這些團隊的非官方統(tǒng)計數(shù)字。NVIDIA(英偉達)內部折疊模擬團隊僅用了10臺機器、花了兩周時間就超越了90%的團隊。NVIDIA(英偉達)團隊添置了更多GPU(圖形處理器)之后,就全時生產效率而言,該團隊在不到一個月的時間內就躋身于僅占總數(shù)0.1%的團隊行列。

  其他蛋白質折疊團隊在使用了NVIDIA Folding@home客戶端后也實現(xiàn)了其排名的提升。

  《PC Games Hardware》編輯Carsten Spille表示:在許多隊員安裝了NVIDIA Folding客戶端之后,我們PC Games Hardware蛋白質折疊團隊實現(xiàn)了在同樣時間內的工作量翻倍。我們每天都能超越許多團隊,終實現(xiàn)了我們躋身世界折疊團隊100強的目標。”

  蛋白質折疊

  蛋白質可以通過一種方法聚集起來,而這種方法就是生物學家所謂的“折疊”。Folding@home項目的目標是了解蛋白質折疊、誤折疊以及相關的疾病。Folding@home模擬蛋白質折疊就是為了了解蛋白質如何快速可靠地折疊以及蛋白質不正確折疊的后果。阿耳茨海默氏病、囊腫性纖維化、瘋牛?。˙SE)、遺傳肺氣腫以及多種癌癥等疾病均被認為是由蛋白質誤折疊所造成。