腸道真菌可預(yù)測(cè)腫瘤免疫治療療效

揭示了腸道真菌譜具有預(yù)測(cè)腫瘤免疫治療療效的作用，且腸道真菌預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性更高。該研究為篩選腫瘤免疫治療的應(yīng)答者，從而提高免疫治療的適用性提供了新思路。

腫瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑(immune checkpoint blockade，ICB)是癌癥治療的重大突破。然而，只有一小部分癌癥患者對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療有應(yīng)答反應(yīng)。近年來(lái)，越來(lái)越多的研究報(bào)道了腸道細(xì)菌結(jié)構(gòu)能影響癌癥患者使用免疫檢查點(diǎn)抑制劑的有效性。然而，人體腸道菌群的構(gòu)成主要由飲食和生活方式?jīng)Q定，不同地區(qū)或人種間的腸道菌群構(gòu)成存在明顯差異。因此，先前研究中關(guān)于免疫檢查點(diǎn)抑制劑療效相關(guān)的腸道菌群特征結(jié)果并不一致。

為了解決這個(gè)問(wèn)題，有學(xué)者對(duì)相關(guān)研究進(jìn)行了整合分析，以確定在不同研究中普遍存在的能預(yù)測(cè)免疫檢查點(diǎn)抑制劑應(yīng)答的細(xì)菌，并對(duì)細(xì)菌的預(yù)測(cè)性能進(jìn)行了評(píng)估。然而，腸道細(xì)菌的預(yù)測(cè)效果并不令人滿意。真菌是人類腸道微生物群中不可或缺的一部分，在塑造宿主免疫和維持腸道內(nèi)穩(wěn)態(tài)方面起著至關(guān)重要的作用，但腸道真菌與免疫檢查點(diǎn)抑制劑應(yīng)答的關(guān)系目前尚不清楚。

本研究整合了來(lái)自不同國(guó)家、不同腫瘤類型的使用ICB治療的9個(gè)宏基因組隊(duì)列，同時(shí)計(jì)算了腸道真菌及細(xì)菌雙界微生物組，發(fā)現(xiàn)了可用于預(yù)測(cè)ICB治療應(yīng)答的真菌及細(xì)菌標(biāo)志物。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)構(gòu)建隨機(jī)森林模型，預(yù)測(cè)癌癥患者對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑的應(yīng)答反應(yīng)。結(jié)果顯示，腸道真菌具有良好的預(yù)測(cè)效能且其預(yù)測(cè)效能比細(xì)菌更高。此外，整合細(xì)菌及真菌雙界標(biāo)志物進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí)會(huì)達(dá)到好的預(yù)測(cè)效果。根據(jù)真菌標(biāo)志物預(yù)測(cè)的應(yīng)答者腫瘤免疫微環(huán)境中有更多的耗竭性T細(xì)胞浸潤(rùn)，且該類患者的生存期優(yōu)于不應(yīng)答者。雙界網(wǎng)絡(luò)分析及微生物功能預(yù)測(cè)分析表明，真菌Schizosaccharomyces octosporus可能在應(yīng)答者腸道中將淀粉發(fā)酵成短鏈脂肪酸，從而促進(jìn)免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療的應(yīng)答。

這項(xiàng)研究首揭示了腫瘤免疫檢查點(diǎn)應(yīng)答者及不應(yīng)答者全面的泛癌腸道真菌譜，發(fā)現(xiàn)了具有良好預(yù)測(cè)性能的雙界微生物標(biāo)記物，突出了真菌在預(yù)測(cè)免疫治療療效方面的潛力，有望提高免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療的適用性，為利用這些標(biāo)志物預(yù)測(cè)免疫檢查點(diǎn)抑制劑療效、改善應(yīng)答提供新思路。